手順
- MinIONの結果を使用してアセンブル(Ra, SMARTdenovo, wtdbg, Canuを使用、Raの結果を採用)
- MinIONの結果を使用して3回ポリッシング(Racon)
- HiSeqの結果を使用して3回ポリッシング(Pilon)
- Saphyr Systemの結果と合わせてHybrid Scaffolding
結果
| 生物種 | Brassica rapa Z1 (yellow sarson) | Brassica oleracea HDEM (broccoli) | Musa schizocarpa (banana) |
| Contig N50 | 5.5 Mb | 9.5 Mb | 10.0 Mb |
| Scaffold N50 | 15.4 Mb | 29.5 Mb | 36.8 Mb |
1/4の染色体が１本のScaffold、66%の染色体が1本もしくは２本のScaffoldにまとまった。